vimperatorのpluginをgitで持ってきたくて、sudo port install GitXしてみる。
今回もすんなり行くと思ったら、db46のビルドで失敗する。
ログを見ると、

 /usr/bin/gcc-4.2 -c -I. -I../dist/.. -I/opt/local/include -I/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/Current/Headers -pipe -O2 -arch x86_64 -fno-strict-aliasing ../dist/../libdb_java/db_java_wrap.c  -fno-common -DPIC -o .libs/db_java_wrap.o
../dist/../libdb_java/db_java_wrap.c:123:17: error: jni.h: No such file or directory

みたいな感じ。
/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/Current/Headers を見ると、ちゃんとjni.hはある。
ある？よくよくみると、jni.h はファイルではなくディレクトリになっている。これでは読めるはずがない。
ファイルの更新時間的に、Xcodeを入れたときにおかしくなったらしい。
こんなところ見てないから、最初からおかしかったのか、Xcodeがおかしいものを入れたのか、Xcodeが壊したのかはわからない。
とりあえずソフトウェア・アップデートでXcodeを3.2.3から3.2.6に上げてみたが改善せず。

$ sudo /Developer/Library/uninstall-devtools --mode=all

でXcodeをアンインストールしてみても変わらない。
developer.apple.comからxcode_3.2.6_and_ios_sdk_4.3.dmgをインストールしてみたら...治った！
これで、無事にgitが使えるようになりました。